Les cinq groupes connexes travaillent une demi-journée, à l'aide d'outils adaptés à leurs besoins, pour identifier les principaux enjeux auxquels fait face la démocratie genevoise. Chaque groupe connexe rédige un résumé pour le groupe général de l'Assemblée citoyenne.
Pendant son premier week-end de travail, le groupe général de l'Assemblée cherche à comprendre le sujet et à repérer les principaux problèmes liés au fonctionnement de la démocratie à Genève. Elle est appuyée par des interventions d'expertes et d'experts de la question (employées et employés de l'administration, politologues, juristes, etc.). Elle prend en considération les enjeux identifiés par les groupes connexes et produit une première liste d'enjeux à traiter, qui seront priorisés lors du deuxième week-end de travail. Elle transmet cette liste aux groupes connexes.