La qualité des eaux de surface du canton est contrôlée mensuellement par des prélèvements et des analyses physico-chimiques et bactériologiques et plusieurs fois dans l'année par des relevés biologiques (faune et flore).
Les résultats servent à poser un diagnostic de l’état écologique des milieux aquatiques du canton et à déterminer l'origine des pollutions et leur impact sur les organismes aquatiques. Ils guident ensuite l’action publique pour résoudre les problématiques et restaurer les écosystèmes aquatiques.
Une attention particulière est apportée aux herbiers du Léman lors de travaux ou d'aménagement. Ces herbiers sont des écosystèmes précieux: ils oxygènent l'eau, contribuent à améliorer la biodiversité aquatique et offrent des habitats pour une grande diversité d'espèces animales, comme les invertébrés, les poissons et les oiseaux d'eau. Le Petit Lac est le secteur le plus propice du Léman pour leur développement, le Canton est responsable de les préserver.
La qualité de l’eau des rivières et du lac n’est pas seulement un enjeu environnemental: c’est un déterminant majeur de la santé humaine. L’approche « Une seule santé », One Health montre que protéger les milieux aquatiques permet de protéger la population, car les pollutions et les pathogènes circulent entre l’environnement, les animaux et les humains.
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Dernière mise à jour: 2 octobre 2026